в автозагрузке не получится на то он и безопасный режим, а вот в реестре, прописавшись в разделе "что нужно загружать по минимуму", вполне возможно
можно прописаться сюда Code: HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Winlogon\Shell будет стартовать в безопасном режиме, но только на рассово верной ХР, с вистами не прокатит такое.