А что гугл не вариант? Первый же запрос выдает кучу линьков на сравнение обоих языков.Например задай: сравнение c# и java В если брать вообщем - оба языка весьма похоже. Для человека неопределившегося с выбором какой из ЯП выбрать - основные критерии это: Java - имеет полную запилку как для винды так и для юникс подобных систем(Java Virtual Machine), C# же официально типизирован только под винду, однако есть такие решения как Mono позволяющих работать не только под виндой(однако функционал не полный, не все доступные библиотеки). О ботах какого типа идет речь?